前沿 | NEW ENGL J MED(IF=79.258)宏基因組測序輔助腦膜炎和腦炎臨床診斷

【出發點】

腦脊液(CSF)的宏基因組測序(NGS)具有在單次測試中鑒定多種病原體的潛力。

【方法】

在一項為期1年的多中心前瞻性研究中,作者團隊研究了CSF的宏基因組測序在住院患者中診斷傳染性腦膜炎和腦炎的有效性。通過正交實驗室測試證實了對宏基因組測序后病原體的所有陽性測試。通過與臨床微生物測序委員會的電話會議和調查引發醫師反饋。通過回顧性圖表評估評估臨床效果。

【結果】

作者團隊在8家醫院招募了204名兒科和成人患者。患者病情嚴重:48.5%的患者入住重癥監護室,所有研究患者中30天死亡率為11.3%。 57名患者(27.9%)共診斷出58種神經系統感染。在這58種感染中,宏基因組測序結果發現13種(22%)未在源醫院通過臨床試驗確定。在剩余的45種感染(78%)中,19種在傳統檢測和宏基因組測序結果中同時進行了診斷。在未通過宏基因組鑒定的26種感染中,11種僅通過血清學檢測確診,7種通過CSF以外的組織樣本診斷,8種由于CSF中的病原體滴度低為陰性。僅由宏基因組測序結果診斷13種中,8個可能具有臨床效果,13種中7個用于指導治療。

【結論】

常規微生物檢測通常不足以檢測所有神經侵襲性病原體。在這項研究中,從腦膜炎或腦炎患者獲得的腦脊液的宏基因組測序改善了神經系統感染的診斷,并在某些情況下提供了可操作的信息。

參考文獻

Wilson MR,Sample HA,Chiu CY,et al.Clinical Metagenomic Sequencing for Diagnosis of Meningitis and Encephalitis.N Engl J Med,2019.

 

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